Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SH3GL2Q99962 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3GL2Q99962 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 600.5 ms