Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYD88Q99836 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYD88Q99836 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms