Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD5Q99666 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD5Q99666 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms