Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDCA3Q99618 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms