Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALS2CR12Q96Q35 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CR12Q96Q35 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms