Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNMA5Q96PV4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNMA5Q96PV4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms