Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ODF3Q96PU9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF3Q96PU9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms