Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCEEQ96PE7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCEEQ96PE7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms