Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLRP3Q96P20 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRP3Q96P20 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms