Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SAMD11Q96NU1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms