Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM20AQ96MK3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM20AQ96MK3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms