Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM227BQ96M60 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM227BQ96M60 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms