Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC74BQ96LY2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms