Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CELF6Q96J87 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CELF6Q96J87 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms