Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ABCC11Q96J66 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC11Q96J66 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC11Q96J66 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms