Protein–RNA interactions for Protein: Q96HW7

INTS4, Integrator complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS4Q96HW7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
INTS4Q96HW7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
INTS4Q96HW7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms