Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR4

ZDHHC12, Probable palmitoyltransferase ZDHHC12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC12Q96GR4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC12Q96GR4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms