Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC97Q96F63 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC97Q96F63 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms