Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH5

RPL39L, 60S ribosomal protein L39-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39LQ96EH5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL39LQ96EH5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39LQ96EH5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms