Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MALSU1Q96EH3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MALSU1Q96EH3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms