Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf8Q96DM3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf8Q96DM3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms