Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NXPE2Q96DL1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms