Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VOPP1Q96AW1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VOPP1Q96AW1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms