Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC102AQ96A19 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms