Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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TRIM63Q969Q1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM63Q969Q1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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