Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNPO1Q92973 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO1Q92973 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms