Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC4Q92889 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC4Q92889 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC4Q92889 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC4Q92889 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC4Q92889 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC4Q92889 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC4Q92889 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC4Q92889 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC4Q92889 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERCC4Q92889 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERCC4Q92889 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERCC4Q92889 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms