Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CELF1Q92879 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CELF1Q92879 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CELF1Q92879 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CELF1Q92879 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CELF1Q92879 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CELF1Q92879 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CELF1Q92879 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CELF1Q92879 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CELF1Q92879 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CELF1Q92879 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CELF1Q92879 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CELF1Q92879 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CELF1Q92879 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CELF1Q92879 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CELF1Q92879 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CELF1Q92879 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CELF1Q92879 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CELF1Q92879 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms