Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX1Q92499 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX1Q92499 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms