Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
C1orf54Q8WWF1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf54Q8WWF1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf54Q8WWF1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf54Q8WWF1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf54Q8WWF1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf54Q8WWF1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf54Q8WWF1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf54Q8WWF1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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