Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC12Q8WVT3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms