Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GIPC3Q8TF64 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GIPC3Q8TF64 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms