Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHDC4Q8TBB5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHDC4Q8TBB5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHDC4Q8TBB5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHDC4Q8TBB5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHDC4Q8TBB5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHDC4Q8TBB5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHDC4Q8TBB5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHDC4Q8TBB5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHDC4Q8TBB5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KLHDC4Q8TBB5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHDC4Q8TBB5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHDC4Q8TBB5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHDC4Q8TBB5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHDC4Q8TBB5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHDC4Q8TBB5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHDC4Q8TBB5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHDC4Q8TBB5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms