Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX2-3Q8TAU0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX2-3Q8TAU0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX2-3Q8TAU0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX2-3Q8TAU0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX2-3Q8TAU0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NKX2-3Q8TAU0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NKX2-3Q8TAU0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NKX2-3Q8TAU0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NKX2-3Q8TAU0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX2-3Q8TAU0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms