Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45GIP1Q8TAE8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms