Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
NUP35Q8NFH5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NUP35Q8NFH5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms