Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CARMIL3Q8ND23 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms