Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP38Q8NB14 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms