Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRPF38AQ8NAV1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF38AQ8NAV1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms