Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC63Q8NA47 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms