Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DTX3Q8N9I9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DTX3Q8N9I9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms