Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPUSD2Q8IZ73 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPUSD2Q8IZ73 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPUSD2Q8IZ73 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPUSD2Q8IZ73 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPUSD2Q8IZ73 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPUSD2Q8IZ73 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPUSD2Q8IZ73 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms