Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLFN12Q8IYM2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms