Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A9Q8IVB4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A9Q8IVB4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms