Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNL1Q8IU54 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFNL1Q8IU54 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNL1Q8IU54 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNL1Q8IU54 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNL1Q8IU54 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNL1Q8IU54 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFNL1Q8IU54 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms