Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCGF5Q86SE9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF5Q86SE9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF5Q86SE9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF5Q86SE9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF5Q86SE9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF5Q86SE9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF5Q86SE9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF5Q86SE9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms