Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP9Q7RTR0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP9Q7RTR0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms