Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
HECW1Q76N89 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
HECW1Q76N89 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
HECW1Q76N89 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
HECW1Q76N89 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
HECW1Q76N89 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
HECW1Q76N89 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms