Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSH2Q76I76 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSH2Q76I76 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms