Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
LRRC9Q6ZRR7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LRRC9Q6ZRR7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LRRC9Q6ZRR7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms